Das Defragmentieren ist eine Optimierungstechnik für die Sektorenbelegung auf Festplatten. Bei der Defragmentierung geht es darum, fragmentierte Datensätze, die auf verschiedenen Sektoren einer Festplatte gespeichert sind, so zu rearrangieren, dass die Anzahl an Fragmenten reduziert wird und die verbleibenden Fragmente möglichst in benachbarten Sektoren gespeichert werden. Wenn möglich sollte der gesamte Datensatz in einem Fragment gespeichert werden. Der Vorteil des Defragmentierens liegt in den kürzeren Zugriffszeiten bei längeren Datensätzen.
Die Defragmentierungssoftware ist im Betriebssystem enthalten und läuft periodisch nach einer bestimmten Zeit oder nach Aufruf automatisch ab.