Wie aus der Bezeichnung Bootvirus hervorgeht, handelt es sich Viren, die den Bootsektor von Disketten oder den Master Boot Record (MBR) von Festplatten infizieren. Sie überschreiben wichtige Informationen für das Booten, so dass das Betriebssystem nicht mehr gestartet werden kann.

Bootviren übernehmen die Startfunktion und die Rolle der Bootroutine und ersetzen den Start im Master Boot Record und früher im Bootsektor auf Disketten. Bootviren waren in den 90er Jahren die am häufigsten vorkommenden Viren, sie waren insofern besonders hartnäckig, weil sie auch auf Disketten, die keinen Bootsektor hatten, übertragen werden und auf jede Diskette unbemerkt kopiert werden konnten.